Questa è l'app Linux chiamata PolyCTLDesigner, la cui ultima versione può essere scaricata come dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata PolyCTLDesigner con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
PolyCTLDesigner
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DESCRIZIONE
Dati i peptidi (epitopi delle cellule T), PolyCTLDesigner seleziona le sequenze fiancheggianti per ottimizzare il legame con TAP e unisce gli oligopeptidi risultanti in un poliepitopo in modo da garantire un'efficiente liberazione di potenziali epitopi mediante processamento proteasomale e/o immunoproteasomiale e minimizzando il numero di epitopi giunzionali. Per la costruzione dei poliepitopi, PolyCTLDesigner utilizza noti modelli amminoacidici di scissione del proteasoma e specificità di legame con TAP. PolyCTLDesigner è anche in grado di scegliere peptidi antigenici che coprono il repertorio HLA selezionato con il tasso di ridondanza desiderato. Date le sequenze antigeniche, PolyCTLDesigner è anche in grado di selezionare gli epitopi T-helper. Per predire gli epitopi delle cellule T, utilizza TEpredict.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Python
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
