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Scarica PolyCTLDesigner per Linux

Scarica gratuitamente l'app PolyCTLDesigner Linux per eseguirla online su Ubuntu online, Fedora online o Debian online

Questa è l'app Linux chiamata PolyCTLDesigner, la cui ultima versione può essere scaricata come dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.

Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata PolyCTLDesigner con OnWorks.

Segui queste istruzioni per eseguire questa app:

- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.

- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.

- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.

- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.

- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.

- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.

PolyCTLDesigner


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DESCRIZIONE

Dati i peptidi (epitopi delle cellule T), PolyCTLDesigner seleziona le sequenze fiancheggianti per ottimizzare il legame con TAP e unisce gli oligopeptidi risultanti in un poliepitopo in modo da garantire un'efficiente liberazione di potenziali epitopi mediante processamento proteasomale e/o immunoproteasomiale e minimizzando il numero di epitopi giunzionali. Per la costruzione dei poliepitopi, PolyCTLDesigner utilizza noti modelli amminoacidici di scissione del proteasoma e specificità di legame con TAP. PolyCTLDesigner è anche in grado di scegliere peptidi antigenici che coprono il repertorio HLA selezionato con il tasso di ridondanza desiderato. Date le sequenze antigeniche, PolyCTLDesigner è anche in grado di selezionare gli epitopi T-helper. Per predire gli epitopi delle cellule T, utilizza TEpredict.



Pubblico

Scienza / Ricerca



Linguaggio di programmazione

Python


Categorie

Bioinformatica

Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.


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