Questa è l'app Linux denominata PolyCTLDesigner da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata PolyCTLDesigner per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
PolyCTLDesigner per l'esecuzione in Linux online
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DESCRIZIONE
Dati i peptidi (epitopi delle cellule T) PolyCTLDesigner seleziona le sequenze fiancheggianti per ottimizzare il legame TAP e unisce gli oligopeptidi risultanti in un poliepitopo in modo da fornire un'efficiente liberazione di potenziali epitopi mediante elaborazione proteasomica e/o immunoproteasomiale e riducendo al minimo il numero di epitopi giunzionali. Per la costruzione di poliepitopi, PolyCTLDesigner utilizza modelli di aminoacidi noti di scissione del proteasoma e specificità di legame TAP. PolyCTLDesigner è anche in grado di scegliere peptidi antigenici che coprono il repertorio HLA selezionato con il tasso di ridondanza desiderato. Date le sequenze antigeniche PolyCTLDesigner è anche in grado di selezionare epitopi T-helper. Per prevedere gli epitopi delle cellule T utilizza TEpredict.Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Python
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.