Questa è l'app Linux denominata SecStAnT da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come SecStAnT.jar. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata SecStAnT per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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SecStanT per l'esecuzione in Linux online
DESCRIZIONE
SecStAnT è uno strumento per la creazione automatica di set di dati di strutture da Protein Data Bank (PDB) con composizione strutturale definita dall'utente e per il calcolo delle loro distribuzioni di variabili interne.SecStanT è in grado di
1. Selezionare dai set di dati PDB di strutture basate su strutture secondarie specificate dall'utente (definite in base alla classificazione PDB interna o su DSSP) e/o motivi di sequenza.
2. Costruisci set di dati a diversi livelli di risoluzione (tutti gli atomi, solo backbone, solo Cα, ...)
3. Valutare le distribuzioni statistiche delle variabili interne:
un. distribuzioni a singola variabile (incluse le più rilevanti nella rappresentazione atomistica, ad es. PHI e PSI e alcune di quelle per la rappresentazione basata su Cα)
B. correlazioni a due variabili (inclusa la mappa PHI-PSI Ramachandran e il suo equivalente nella rappresentazione basata su Cα)
C. tre variabili correlazioni
Interfaccia utente
Altalena Java
Linguaggio di programmazione
Java
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/secstant/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
