Questa è l'app Linux denominata SPSens la cui ultima versione può essere scaricata come SPSensbeta.3.4.tgz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata SPSens con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
SPSens
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DESCRIZIONE
SPSens è un pacchetto software completo scritto in C che stima la sensibilità dei parametri per modelli stocastici di reti di reazioni chimiche e biochimiche utilizzando simulazioni stocastiche Monte Carlo (MC). È possibile stimare le sensibilità rispetto ai parametri del sistema utilizzando i seguenti algoritmi: metodi alle differenze finite (greggio montecarlo, cammino comune di reazione, differenze finite accoppiate); metodi del rapporto di verosimiglianza; e derivati pathwise regolarizzati.
Inoltre, il pacchetto include algoritmi di simulazione stocastica di base. Il pacchetto include diverse reti di esempio che possono essere facilmente modificate per altre reti.
Le implementazioni MPI seriali e parallele possono essere compilate e chiamate dalla riga di comando. L'implementazione seriale del pacchetto può anche essere chiamata da Matlab tramite l'interfaccia MEX con funzionalità limitate. Supporta molte opzioni specificate dall'utente, incluso l'uso del campionamento antitetico che può essere utilizzato in alcuni casi per aumentare l'efficienza.
Pubblico
Scienza/Ricerca, Ingegneria
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
C
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/spsens/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
