Questa è l'app Linux denominata SSC la cui ultima versione può essere scaricata come SSC0.1.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata SSC con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
SSC
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DESCRIZIONE
SSC è uno strumento per prevedere l'efficienza di sgRNA da sequenze di spaziatori. Supporta le applicazioni di ottimizzazione delle librerie di sgRNA nelle schermate di inibizione/attivazione CRISPR/Cas9 o CRISPR/dCas9.Caratteristiche
- Estrazione di sequenze di spaziatori candidati dal file .fasta
- Prevedere l'efficienza dello sgRNA dalle sequenze spaziatrici, per la progettazione della libreria nel knockout di CRISPR/Cas9 e nell'inibizione o attivazione di CRISPR/dCas9.
- fornire matrici che supportino: spaziatori da 19-20 bps in knockout CRISPR/Cas9, ottimizzati per il genoma umano e murino.
- fornire matrici che supportino: spaziatori da 19-21 bps in CRISPR/dCas9, ottimizzati per il genoma umano.
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/spacerscoringcrispr/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
