זוהי הפקודה altree-add-Sp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
altree-add-S - כותרת...
תַקצִיר
altree-add-S [אפשרויות]
אפשרויות:
--גרסה גרסת תוכנית
--short-help|h הודעת עזרה קצרה
-- הודעת עזרה עם תיאורי אפשרויות
--מן תיעוד מלא
--first-input-file|קובץ קלט 1
--second-input-file|j קובץ קלט 2 נתונים הנוגעים לתכונה (איכותית או כמותית)
--output-file|o קובץ פלט
--epsilon|e epsilon ערך
--data-type|t סוג נתונים: SNP או DNA
--פרופורציה|p חלק מהמקרים במדגם (לנתונים איכותיים בלבד)
--data-qual|q סוג נתונים: איכותי או כמותי
[--outgroup|g] שם ה-outgroup
--low|l אם הפלוטיפ קיים שווה או פחות מ-1 פעמים, המצב של S יוגדר ל-"?"
אפשרויות
--גִרְסָה
הדפס את גרסת התוכנית ויציאה.
--קצר-עזרה
הדפס הודעת עזרה קצרה וצא.
- עזרה הדפס הודעת עזרה עם תיאורי אפשרויות ויציאות.
--איש מדפיס את הדף הידני ויוצא.
--first-input-file|i
קובץ קלט 1 (קובץ paup או phylip)
---Second-input-file|j
קובץ קלט 2, מכיל את מספר הפעמים שהפלוטייפ נתון מועבר לפי מקרה
ולשלוט ביחידים (נתונים איכותיים) או בערכים הכמותיים
תואם להפלוטיפ נתון (נתונים כמותיים)
--output-file|o
קובץ פלט
--epsilon|ה
פרמטר espilon (ראה נוסחה בתיעוד)
---data-type|t
סוג הנתונים: DNA (ATGCU) או SNP (0-1)
--פרופורציה|עמ'
שיעור יחידי המקרים במדגם
--קבוצת חוץ|ג
שם קבוצת החוץ (אם הוא לא בקובץ המכיל את מספר המקרים ו
בקרות לפי הפלוטיפ)
--data-qual|q
ציין אם הנתונים הם איכותיים או כמותיים
--נמוך|ל אם הפלוטיפ קיים שווה או פחות מ-1 פעמים, המצב של S ייקבע
ל "?"
תיאור
זֶה התוכנית מוסיף תו חדש (הנקרא "תו S") לכל הפלוטיפ בקלט
תיק לפי מספר התיקים והבקרות הנושאות אותו.
השתמש ב-altree-add-Sp באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
