זוהי הפקודה bp_parse_hmmsearchp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_parse_hmmsearch - ניתוח קובץ/קבצי תוצאות HMMSEARCH יחיד/מרובה באמצעות
אפשרויות פלט שונות
תַקצִיר
bp_parse_hmmsearch [--po] [--ps] -s hmmsearch_file
bp_parse_hmmsearch [--po] [--ps] -m קובץ_אינדקס
תיאור
חובה אפשרויות:
-s קובץ HMMSEARCH לניתוח.
קובץ INDEX -m המכיל רשימה של קבצי HMMSEARCH עבור מספר רב של
ניתוח.
מיוחד אפשרויות:
--po הדפס רק את ההתאמות בעלות ציונים חיוביים.
--ps הדפס את סך כל הציונים החיוביים שנמצאו.
--עזרה הצג תיעוד זה.
מָשׁוֹב
תפוצה רשימות
משוב משתמשים הוא חלק בלתי נפרד מההתפתחות של מודול זה ושל מודולים אחרים של ביופרל. לִשְׁלוֹחַ
ההערות וההצעות שלך רצוי לרשימת התפוצה של ביופרל. השתתפותך
מוערך מאוד.
[מוגן בדוא"ל] - דיון כללי
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - לגבי רשימות התפוצה
דווח באגס
דווח על באגים למערכת מעקב באגים ביופרל כדי לעזור לנו לעקוב אחר הבאגים ושלהם
פתרון הבעיה. ניתן להגיש דוחות באגים דרך האינטרנט:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
השתמש ב- bp_parse_hmmsearchp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
