זוהי הפקודה bp_parse_hmmsearchp שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_parse_hmmsearch - ניתוח קבצי תוצאות בודדים/מרובים של HMMSEARCH עם
אפשרויות פלט שונות
תַקצִיר
bp_parse_hmmsearch [--po] [--ps] -s hmmsearch_file
bp_parse_hmmsearch [--po] [--ps] -m index_file
תיאור
חובה אפשרויות:
קובץ HMMSEARCH לניתוח.
-m INDEX קובץ המכיל רשימה של קבצי HMMSEARCH עבור קבצים מרובים
ניתוח.
מיוחד אפשרויות:
--po הדפס רק את הלהיטים שיש להם ציונים חיוביים.
--ps הדפס את סך הציונים החיוביים שנמצאו.
--help הצג את התיעוד הזה.
מָשׁוֹב
תפוצה רשימות
משוב משתמשים הוא חלק בלתי נפרד מההתפתחות של מודול זה ושל מודולים אחרים של ביופרל. לִשְׁלוֹחַ
ההערות וההצעות שלך רצוי לרשימת התפוצה של ביופרל. השתתפותך
מוערך מאוד.
[מוגן בדוא"ל] - דיון כללי
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - לגבי רשימות התפוצה
דווח באגס
דווח על באגים למערכת מעקב באגים ביופרל כדי לעזור לנו לעקוב אחר הבאגים ושלהם
פתרון הבעיה. ניתן להגיש דוחות באגים דרך האינטרנט:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
השתמש ב-bp_parse_hmmsearchp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net
