cmtk-glm - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

glm - מודל ליניארי כללי

תַקצִיר

glm [אפשרויות] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]

תיאור

מידול סטטיסטי של עוצמות פיקסלים במספר תמונות באמצעות מודל ליניארי כללי.

המשתנים הבלתי תלויים של המודל מוגדרים באחד מקבצי בקרה נוספים. כל אחד
קובץ control הוא קובץ טקסט עם עמודה אחת מופרדת ברווח לבן לכל משתנה בלתי תלוי.

השורה הראשונה של קובץ הבקרה מגדירה את שמות המשתנים, כלומר, התוויות ש
לזהות כל משתנה. כל שורה הבאה מכילה ערך אחד לכל משתנה בלתי תלוי.

דוגמא:

מין גיל תעודת זהות
01 20 0
02 30 1

כל שם קובץ בקרה מלווה בתבנית שם קובץ. בדפוס זה, '%s' בודד
מחזיק המקום מוחלף בערך שנמצא בעמודה הראשונה של כל שורת קובץ בקרה.
המחרוזת המתקבלת היא הנתיב של התמונה הנקראת ומשויכת למשתני המודל
רשום בשורת קובץ הבקרה הספציפית.

באמצעות דוגמה של קובץ הבקרה שלמעלה, התבנית 'images/subject%s.nii' תתרחב
שמות קבצי התמונה 'images/subject01.nii' ו-'images/subject02.nii'.

ניתן להשתמש במספר קבצי בקרה, כל אחד עם תבנית קובץ תמונה שונה.

אפשרויות

גלוֹבָּלִי ארגז כלים אפשרויות (אלה יש לו משותף by את כל CMTK כלים)
- עזרה
כתוב רשימה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות לפלט סטנדרטי.

--לעזור לכולם
כתוב רשימה מלאה של אפשרויות שורת פקודה בסיסיות ומתקדמות לפלט סטנדרטי.

--וויקי
כתוב רשימה של אפשרויות שורת הפקודה לפלט סטנדרטי בסימון MediaWiki.

--איש
כתוב מקור דף אדם בסימון 'nroff' לפלט סטנדרטי.

--גִרְסָה
כתוב גרסת ערכת כלים לפלט סטנדרטי.

--הֵד
כתוב את שורת הפקודה הנוכחית לפלט סטנדרטי.

--רמת מילולית
הגדר את רמת הדיבור.

--מִלוּלִי, -v
הגדל את רמת המילוליות ב-1 (הוצא משימוש; נתמך עבור תאימות לאחור).

--חוטים
הגדר את המספר המרבי של שרשורים מקבילים (עבור שרשורי POSIX ו-OpenMP).

קֶלֶט הגדרות
--יְבוּל , -c
כדי לחסוך במקום/זמן, חתוך תמונות: x0,y0,z0,x1,y1,z2

מספר סימוכין הגדרות
--לנרמל, -n
נרמל פרמטרים של מודל לפי סטיות נתונים.

--exp, -e
השתמש במודל אקספוננציאלי ולא במודל ליניארי.

בחירה of עצמאי משתנים
--exclude-constant, -x
אל תכלול פרמטר קבוע אוטומטי מהדגם.

--- ignore-parameter , -i
התעלם מפרמטר עם NUMBER נתון (0..n-1). ניתן לחזור.

--בחר-פרמטר , -s
בחר פרמטר עם NAME נתון עבור הדגם. ניתן לחזור.

תְפוּקָה הגדרות
--דפוס פלט , -O
דפוס שם קובץ לפלט.

%s מוחלף בסוג תמונה ('fstat', 'tstat' או 'param')
%d מוחלף במספר משתנה בלתי תלוי (0 עבור הדגם כולו)
%s מוחלף בשם משתנה בלתי תלוי ('מודל' עבור המודל כולו)

[בְּרִירַת מֶחדָל: model_%s_%02d_%s.nii ]

מחברים

טורסטן רוהלפינג, עם תרומות ממייקל פ. האסק, גרג ג'פריס, קלווין ר.
מאורר, דניאל ב' רוסקוף וירוסלב הלצ'נקו

השתמש ב-cmtk-glm באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net