זוהי הפקודה dbifastae שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
dbifasta - אינדקס מסד נתונים של קבצי fasta
תַקצִיר
דביפסטה -dbname מחרוזת -idformat רשימה -מַדרִיך בספרייה -שמות קבצים מחרוזת
-לְשַׁחְרֵר מחרוזת -תַאֲרִיך מחרוזת -שדות רשימה -לא לכלול מחרוזת -maxindex מספר שלם
-מיונים מחרוזת -מיון מערכות בוליאני -לנקות בוליאני -תיק אוסף
-indexoutdir outdir
דביפסטה עזרה
תיאור
דביפסטה היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "Utils:Database indexing".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-dbname מחרוזת
-idformat רשימה
ערך ברירת מחדל: idacc
-מַדרִיך בספרייה
ערך ברירת מחדל: .
-שמות קבצים מחרוזת
ערך ברירת מחדל: *.dat
דרוש סעיף
-לְשַׁחְרֵר מחרוזת
ערך ברירת מחדל: 0.0
-תַאֲרִיך מחרוזת
ערך ברירת מחדל: 00/00/00
מתקדם סעיף
-שדות רשימה
ערך ברירת מחדל: acc
-לא לכלול מחרוזת
-maxindex מספר שלם
-מיונים מחרוזת
אפשרויות מיון, בדרך כלל '-T .' להשתמש בספרייה הנוכחית עבור קבצי עבודה וב-'-k 1,1' כדי
לאלץ מיון GNU להשתמש בשדה הראשון ערך ברירת מחדל: -T . -ק 1,1
-מיון מערכות בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
-לנקות בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף
-indexoutdir outdir
ערך ברירת מחדל: .
השתמש ב-dbifastae באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
