זוהי הפקודה fastq_quality_filter שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fastq_quality_filter - מסנן רצפים על סמך איכות
תיאור
usage: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] חלק מה
FASTX Toolkit 0.0.14 מאת A. Gordon ([מוגן בדוא"ל])
[-h] = מסך עזרה מועיל זה.
[-q N] = ציון איכות מינימלי לשמירה.
[-p N] = אחוז מינימלי של בסיסים שחייבים להיות בעלי איכות [-q].
[-z] = דחוס פלט עם GZIP.
[-i INFILE]
= קובץ קלט FASTA/Q. ברירת המחדל היא STDIN.
[-o OUTFILE] = קובץ פלט FASTA/Q. ברירת המחדל היא STDOUT. [-v] = מילולית -
דווח על מספר רצפים.
אם צוין [-o],
הדוח יודפס ל-STDOUT.
אם [-o] לא צוין (והפלט עובר ל-STDOUT), הדוח יודפס אל
STDERR.
השתמש ב-fastq_quality_filter באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
