fastq_to_fasta - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

fastq_to_fasta - המרת קבצי FASTQ לקבצי FASTA

תיאור

שימוש: fastq_to_fasta [-h] [-r] [-n] [-v] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] חלק מ-FASTX
ערכת כלים 0.0.14 מאת א. גורדון ([מוגן בדוא"ל])

[-h] = מסך עזרה מועיל זה.

[-r] = שנה את שם מזהי הרצף למספרים.

[-n] = לשמור על רצפים עם נוקלאוטידים לא ידועים (N).

ברירת המחדל היא להשליך רצפים כאלה.

[-v] = מילולית - דווח על מספר רצפים.

אם צוין [-o],
הדוח יודפס ל-STDOUT.

אם [-o] לא צוין (והפלט עובר ל-STDOUT), הדוח יודפס אל
STDERR.

[-z] = דחוס פלט עם GZIP.

[-i INFILE]
= קובץ קלט FASTA/Q. ברירת המחדל היא STDIN.

[-o OUTFILE] = קובץ פלט FASTA. ברירת המחדל היא STDOUT.

השתמש ב-fastq_to_fasta באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net