זוהי הפקודה fastx_trimmer שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fastx_trimmer - FASTA/Q Trimmer
תיאור
שימוש: fastx_trimmer [-h] [-f N] [-l N] [-t N] [-m MINLEN] [-z] [-v] [-i INFILE] [-o
OUTFILE] חלק מ-FASTX Toolkit 0.0.14 מאת א. גורדון ([מוגן בדוא"ל])
[-h] = מסך עזרה מועיל זה.
[-f N] = הבסיס הראשון שיש לשמור. ברירת המחדל היא 1 (=בסיס ראשון).
[-l N] = הבסיס האחרון שיש לשמור. ברירת המחדל היא קריאה מלאה.
[-t N] = חתוך N נוקלאוטידים מסוף הקריאה.
לא ניתן להשתמש ב-'-t' עם '-l' ו-'-f'.
[-מ MINLEN]
= עם [-t], בטל קריאות קצרות מ-MINLEN.
[-z] = דחוס פלט עם GZIP.
[-i INFILE]
= קובץ קלט FASTA/Q. ברירת המחדל היא STDIN.
[-o OUTFILE] = קובץ פלט FASTA/Q. ברירת המחדל היא STDOUT.
השתמש ב-fastx_trimmer באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
