זוהי הפקודה hmmconvert שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
hmmconvert - המרת קובץ פרופיל לפורמט HMMER
תַקצִיר
מממיר [אפשרויות]
תיאור
השמיים מממיר כלי השירות ממיר קובץ פרופיל קלט לפורמטים שונים של HMMER.
כברירת מחדל, פרופיל הקלט יכול להיות בכל פורמט HMMER, כולל פורמטים ישנים/מיושנים
מ-HMMER2, ASCII או בינארי; פרופיל הפלט הוא פורמט HMMER3 ASCII נוכחי.
עשוי להיות '-' (מקף), כלומר קריאת קלט זה סטדין במקום קובץ.
אפשרויות
-h עֶזרָה; הדפס תזכורת קצרה לגבי השימוש בשורת הפקודה וכל האפשרויות הזמינות.
-a פלט פרופילים בפורמט טקסט ASCII. זוהי ברירת המחדל.
-b פלט פרופילים בפורמט בינארי.
-2 פלט בפורמט טקסט HMMER2 ASCII מדור קודם, במצב ls (גלוקלי). זה מאפשר HMMER3
מודלים שיומרו בחזרה לקירוב קרוב של HMMER2, לשם השוואה
מחקרים.
--outfmt
פלט בפורמט טקסט HMMER3 ASCII אחר מהנוכחי ביותר. תָקֵף
אפשרויות עבור הם 3/a עד 3/f. הפורמט הנוכחי הוא 3/f, וזהו
בְּרִירַת מֶחדָל. הפורמט 3/b שימש במהדורה הרשמית של HMMER3, ובאחרים
שימשו בגרסאות הבדיקה השונות.
השתמש ב-hmmconvert באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
