זוהי הפקודה indigo-cano שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
indigo-cano - הפקת SMILES קנוניים או קוד שכבות למולקולות בפורמט MOL או SDF
תַקצִיר
אינדיגו-קנו שם קובץ.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [פרמטרים]
אינדיגו-קנו - סמיילים [פרמטרים]
תיאור
אינדיגו-קנו משמש להפקת SMILES קנוניים או קוד שכבות עבור מולקולות ב-MOL או
פורמט SDF.
אפשרויות
אינדיגו-קנו מצפה לקובץ או לקוד SMILES בקלט הסטנדרטי, שאז עשוי להיות
ואחריו אחד או יותר מהפרמטרים הבאים.
-חברים
פלט SMILES קנוני (ברירת מחדל)
-מְרוּבָּד
פלט קוד שכבות קנוני
-
שדה מזהה עם השם הנתון בקובץ SDF
-אין-ארום
אין לבצע ארומטיזציה של מולקולות
-ללא טטרהדרל
התעלם ממרכזי סטריאו-טטרהדרלים
-ללא ציסטרנס
התעלם ממידע על אג"ח ציס-טרנס
דוגמאות
אינדיגו-קנו infile.sdf
אינדיגו-קנו infile.sdf.gz - מולרגנו > results.txt
אינדיגו-קנו infile.smi -מְרוּבָּד -ללא ציסטרנס
אינדיגו-קנו - 'NC1C=CC(O)=CC=1'
השתמש באינדיגו-קאנו באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
