substitch.pl - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

substitch.pl -- פיצול/מזג קבצי תפרים לתוך/חוץ מקבצי תפרים

תַקצִיר

substitch.pl --split 5 allchromosomes.stitch #split תפר גדול ל-5 שווים בערך
גושים

substitch.pl --project allspecies.seqs sub.anchors #project some anchors into a different
מרחב קואורדינטות (כל עוד רצפי רכיבי התפרים תואמים)

אפשרויות

--verbose => עושה יותר מילולי --faketfidf => ציוני tfidf מזויפים המבוססים על נתוני ציון ב
פילה

הערה על פיצול: תוכנית זו אינה מתיימרת לייצר פיצול אופטימלי. זה מנסה א
היוריסטיקה זוגית, מחדד את התוצאות ובוחרת את הסידור הטוב ביותר שנמצא עד כה.
מבחינה טכנית זוהי וריאציה על "בעיית אריזת תא המטען" המסורתית, שהיא (ב
לפחות במקרה המופשט) NP-hard, אם אני זוכר נכון את 15-251. הספציפי הזה
עם זאת, מגוון של אריזות תא המטען נראה כאילו זה אמור להיות פתיר מהר יותר (במקרה הגרוע יש כמה
n^k תכנות דינמי אני חושב, אבל אני מהמר שהדרך הזו מהירה יותר והרבה יותר קלה
כתוב עבור 90% מהמקרים שם). אם מישהו קורא את זה אומר "אידיוט, זה קרה
נפתר כבר אלף פעמים," אנא ספר לי כיצד: [מוגן בדוא"ל]

השתמש ב-substitch.pl באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net