זוהי אפליקציית לינוקס בשם Biological Pathway Exchange Language להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-paxtools-5.1.0.jar. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם Biological Pathway Exchange Language כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
שפת חילופי נתיבים ביולוגיים להפעלה מקוונת בלינוקס
Ad
תיאור
BioPAX היא שפה סטנדרטית לאינטגרציה, החלפה, הדמיה וניתוח של נתוני מסלול ביולוגי. BioPAX תומכת בחילופי נתונים בין קבוצות נתוני מסלול ובכך מפחיתה את המורכבות של החלפה בין פורמטי נתונים על ידי מתן פורמט סטנדרטי מקובל לנתוני מסלול. על ידי הצעת תקן, עם סמנטיקה מוגדרת היטב לייצוג מסלולים, BioPAX מאפשר למסדי נתונים ותוכנות מסלולים לקיים אינטראקציה יעילה יותר. בנוסף, BioPAX מאפשרת פיתוח של הדמיית מסלול מבסיסי נתונים ומאפשרת ניתוח נתונים שנוצרו בניסוי באמצעות שילוב עם ידע קודם. המאמץ של BioPAX מתואם באופן הדוק עם זה של יוזמות תקנים אחרות הקשורות למסלול, כלומר; PSI-MI, SBML, CellML ו-SBGN על מנת לספק תקן תואם בתחומים שבהם הם חופפים.תכונות
- תיעוד ודוגמאות של BioPAX
- Paxtools (BioPAX API)
- BioPAX Validator
- ממירי BioPAX
קהל
מדע/מחקר
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/biopax/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
