זוהי אפליקציית לינוקס בשם GenOO-HTS להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם genoo-code-2013_04_18.tar.gz. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם GenOO-HTS כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
GenOO-HTS להפעלה מקוונת בלינוקס
תיאור
GenOO-HTS [jee-noo] היא מסגרת Perl בקוד פתוח, מונחה עצמים, שפותחה במיוחד לתכנון כלי ניתוח ריצוף תפוקה גבוהה (HTS). המטרה העיקרית של GenOO-HTS היא להפוך ניתוחי HTS פשוטים לקלים וניתוחים מורכבים לאפשריים. GenOO-HTS מדמה ישויות ביולוגיות לאובייקטי Perl ומספק תכונות ושיטות רלוונטיות המאפשרות מניפולציה של נתוני ריצוף תפוקה גבוהה. השימוש ב-GenOO-HTS כמודול פיתוח מרכזי מפחית את התקורה והמורכבות של ניהול הנתונים והישויות הביולוגיות הקיימות. GenOO-HTS תוכנן להיות גמיש, ניתן להרחבה בקלות עם מבנה מודולרי ודרישות מינימליות עבור כלים וספריות חיצוניים.תכונות
- ארגון ישויות ביולוגיות כאובייקטים של פרל (אזורים גנומיים, גנים, תמלילים, אינטרונים/אקסונים וכו')
- ארגון ישויות ריצוף כאובייקטים/מאפיינים של פרל (קריאות ריצוף, יישורים וכו')
- הפיכת קלט/פלט (I/O) מפורמטי קבצים נפוצים לקל (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- להיות עקבי וניתן להרחבה בקלות
קהל
מדע/מחקר, מפתחים
שפת תכנות
פרל
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/genoo/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
