זוהי אפליקציית לינוקס בשם תוכנת GMATA עבור סמן Genomic SSR שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור GMATAv2.2.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם תוכנת GMATA עבור סמן Genomic SSR עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
תוכנת GMATA לסמן Genomic SSR
תיאור
מהי תוכנה GMATA v21
Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) לכל רחבי הגנום היא תוכנה לניתוחי רצף חוזרים (SSR) ועיצוב ומיפוי של סמני SSR בכל רצף DNA. יש לו את הפונקציות הבאות:
1. כריית SSR;
2. ניתוח סטטיסטי ושרטוט;
3. צפייה גרפית של לוקוס SSR;
4. עיצוב מרקר;
5. מיפוי אלקטרוני וחקירת העברה של סמנים.
GMATA מדויק, רגיש ומהיר. הוא תוכנן לעבד מערכי נתונים גדולים של רצף גנומי, במיוחד רצפי גנום שלם גדולים. בתיאוריה, ניתן לנתח גנומים בכל גודל על ידי GMATA בקלות. תוכנת GMATA עובדת על שרת, שולחני או אפילו מחשב נייד, והיא יכולה לפעול בממשק גרפי בלחיצות בלבד או לרוץ בשורת הפקודה או בצינור אוטומטי. הוא גם חוצה פלטפורמות ותומך ב-Unix/Linux, Win ו-Mac. תוצאות מתוכנת GMATA יכולות להיות מוצגות ישירות בצורה גרפית עם תכונות גנום או גנים ב-Gbrowser ולשלב בקלות עם כל מסד נתונים גנומי.
תכונות
- כריית SSR המדויקת והמהירה ביותר בכל רצף גדול
- ניתוח סטטיסטי מלא ותכנון
- מיקומי SSR וסמנים המוצגים ב-Gbrowser עם תכונות גנום
- עיצוב סמן SSR ספציפי ו-PCR מדומה
- מיפוי אלקטרוני, וחקירת העברה של סמנים
- זמין גם ב https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/gmata/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
