זוהי אפליקציית לינוקס בשם GMcloser שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור GMcloser-1.6.2.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם GMcloser עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
GM קרוב יותר
Ad
תיאור
GMcloser ממלא וסוגר את הפערים הקיימים במכלולי פיגומים, במיוחד אלה שנוצרו על ידי הרכבה דה נובו של גנומים שלמים עם קריאות רצף הדור הבא (NGS). בניגוד לכלים אחרים לסגירת פערים המשתמשים בקריאה של NGS בלבד, GMcloser משתמשת בסטים מורכבים מראש או בערכות קריאה ארוכות כרצפים לסגירת פערים ומשתמשת בקריאות קצה זוגיות (PE) ובאלגוריתם מבוסס סבירות לשיפור הדיוק והיעילות של הפער. סגירת מעגל. ניתן להגביר את היעילות של סגירת הפערים על ידי טיפולים עוקבים עם סטים שונים.חבילה נלווית, GMvalue, היא כלי לקביעת אתרי הרכבה שגויה בקונטיגים ובפיגומים. בניגוד לכלים קשורים אחרים, GMvalue יכול להגדיר קטגוריות אי-הרכבה עם מספר אפשרויות, וניתן להחיל אותו על מכלולים של גנום בגודל גדול. על ידי שימוש באפשרות -e, GMvalue מייצר גם הרכבות ללא שגיאות על ידי פיצול או תיקון אי-הרכבות.
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/gmcloser/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.