זוהי אפליקציית לינוקס בשם lr2rmats להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם lr2rmats כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
lr2rmats להפעלה מקוונת בלינוקס
תיאור
lr2rmats הוא צינור RNA קל משקל מבוסס Snakemake, שנועד להשתמש בנתוני RNA-seq דור שלישי לקריאה ארוכה ודור שני לקריאה קצרה כדי ליצור קובץ ביאור גנים משופר. קובץ הביאור החדש שנוצר יוכל להיות מסופק ל-rMATS לצורך ניתוח שחבור חלופי דיפרנציאלי.מידע נוסף ניתן למצוא בכתובת https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
תכונות
- קריאה ארוכה
- RNA-seq
- שחבור חלופי
- מדעי הביולוגיה הפסיפית
- אוקספורד ננופור טכנולוגיות
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Unix Shell, Python, C
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מאתר https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להריץ אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
