זוהי אפליקציית לינוקס בשם miRDP2 להפעלה מקוונת בלינוקס, וניתן להוריד את הגרסה האחרונה שלה בשם miRDP2-v1.1.4.tar.gz. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם miRDP2 כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
miRDP2 להפעלה מקוונת בלינוקס
Ad
תיאור
miRDeep-P2 (miRDP2) פותח כדי לנתח במדויק ומהיר מיקרו-RNA (miRNAs) transcriptome בצמחים. הוא אומץ מ-miRDeep-P (miRDP) עם אסטרטגיות חדשות ואלגוריתם מחודש. בדקנו את miRDP2 כדי לנתח תעתיקי מירנה בצמחים כאלה עם גודל גנום מוגדל בהדרגה כמו ארבידופסיס, אורז, עגבנייה, תירס וחיטה. בהשוואה ל-miRDeep-P ולמספר כלי חישוב אחרים, miRDP2 עיבד נתוני NGS במהירות מעולה. על ידי שילוב קריטריוני ביאור של הצמח המעודכנים החדשים, הדיוק של miRDP2 גם משתפר באופן ניכר. התוצאות שלנו מדגימות את miRDP2 ככלי מהיר ומדויק לניתוח תעתיק ה-miRNA בצמחים.התייחסות: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
תכונות
- RNA קטן
- microRNA(miRNA)
- רצף הדור הבא (NGS)
- פרל
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פרל
סביבת מסד נתונים
פרל DBI/DBD
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/mirdp2/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.