זוהי אפליקציית לינוקס בשם ProGraphMSA שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם ProGraphMSA-20130709.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם ProGraphMSA עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
ProGraphMSA
Ad
תיאור
ProGraphMSA הוא כלי יישור רצף מרובה מתקדם המייצר דפוסי פערים הגיוניים מבחינה פילוגנטית תוך שמירה על חוסן על ידי מתן אפשרות שחבורים חלופיים ושגיאות בדפוס ההסתעפות של עץ המדריך. זה מושג על ידי שילוב ייצוג רצף מבוסס גרף כמו ב-POA ומשלב אותו עם היתרונות של האלגוריתם המודע לפילוגניה ב-Prank. יתר על כן, אנו מסבירים את השונות בדפוס ההחלפה על ידי שימוש בתדרים משוערים של חומצות אמינו ועל ידי יישום פרופילים ספציפיים להקשר כמו ב-CS-Blast.הגרסאות העדכניות ביותר של ProGraphMSA כוללות והרחבה למודל היישור כדי לתמוך בהכנסות ומחיקות של יחידות חוזרות.
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מאתר https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
