זוהי אפליקציית לינוקס בשם Protein Contact Matrix Generator שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלו בתור PCMGen1.0_executable.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Protein Contact Matrix Generator עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
מחולל מטריצות מגע חלבון
תיאור
מטריצת מגע חלבון היא ייצוג דו-ממדי של המרחקים בין שיירי חומצות אמינו במבנה חלבון תלת-ממדי. Protein Contact Map Generator (PCMGen) הוא כלי שורת פקודה שלוקח מבנים תלת-ממדיים של חלבון (קבצי פורמט PDB) כקלט ומחשב מרחקי מגע בין שתי שרשראות (מחלבונים בודדים או שניים שונים). ניתן להמחיש עוד יותר את קבצי המטריצה הללו כמפות אנשי קשר באמצעות כלי/תוכניות הדמיה אחרים (כמו מפות חום R).
ניתן להשתמש במפות מגע להבנת חלבונים':
1. מבנים משניים
2. הסדרים קונפורמטיביים
3. אינטראקציות על פני השטח
תכונות
- אינפורמטיקה מבנית
- מפת יצירת קשר עם חלבון
- יישום CLI מבוסס Java
קהל
משתמשי קצה/שולחן עבודה
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/proteincontactmap/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
