זוהי אפליקציית לינוקס בשם SSC שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בתור SSC0.1.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם SSC עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
SSC
Ad
תיאור
SSC הוא כלי לניבוי יעילות sgRNA מרצפי מרווחים. הוא תומך ביישומים של אופטימיזציה של ספריות sgRNA במסכי עיכוב/הפעלה של CRISPR/Cas9 או CRISPR/dCas9.תכונות
- חילוץ רצפי מרווח מועמדים מקובץ .fasta
- חיזוי יעילות sgRNA מרצפי המרווחים, לעיצוב ספרייה בנוק-אאוט של CRISPR/Cas9 ועיכוב או הפעלה של CRISPR/dCas9.
- לספק מטריצות התומכות ב: מרווחים של 19-20 bps בנוק-אאוט של CRISPR/Cas9, מותאם לגנום אנושי ועכבר.
- לספק מטריצות התומכות ב: 19-21 bps spacers ב-CRISPR/dCas9, מותאם לגנום אנושי.
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/spacerscoringcrispr/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.