זוהי אפליקציית Windows בשם Molecular Dynamics Studio אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-WindowsRelease.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Molecular Dynamics Studio עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
בצילומי מסך
Ad
סטודיו מולקולרית דינמיקה
תיאור
זהו אוסף של שינויים בתוכנה שנוצרו כדי לשלב את NanoEngineer-1, PACKMOL ו-MSI2LMP לצורך יצירת תאים דינמיים מולקולריים בקלות. NanoEngineer-1 היא תוכנת CAD מולקולרית שנכתבה על ידי Nanorex ומספקת למשתמש דרך קלה ליצור מולקולות, בעוד ששינויי התוכנה מאפשרים למשתמש להקליד אטומים באמצעות שדות כוח מרובים. PACKMOL יכולה ליצור אוסף אקראי של מולקולות באמצעות תבניות המולקולה של NanoEngineer-1 ובכך לספק את תא ה-MD הראשוני. שינויים ב-PACKMOL מאפשרים להעביר את נתוני סוג האטום לתוכנת MSI2LMP. MSI2LMP יוצר קובץ קלט LAMMPS המבוסס על שדות כוח מסוג Class I או Class II. MSI2LMP שונה לשימוש בנתוני שדות כוח מקודדים מספריים שנוצרו על ידי NanoEngineer-1. פורמט הקובץ MMP הוארך ושולב בכל שלושת יישומי התוכנה.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
תכונות
- יכולת CAD מולקולרית באמצעות NanoEngineer-1
- הקלד ידני אטומים על סמך שדה הכוח האטומי CFF91
- צור תבניות מולקולות באמצעות NanoEngineer-1
- צור תא MD באמצעות PACKMOL ותבניות מולקולות מרובות
- צור קובץ קלט גיאומטריית LAMMPS באמצעות MSI2LMP
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
OpenGL, Qt
שפת תכנות
Fortran, Python, C++, C
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.