これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド asn2ff です。
プログラム：
NAME
asn2ff - ASN.1 生物学的データをフラット形式に変換します (旧バージョン)
SYNOPSIS
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a ファイル名] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l ファイル名] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o ファイル名] [-p F] [-q] [-r ファイル名] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
DESCRIPTION
asn2ff 生物学的配列の記述を NCBI の ASN.1 形式から次のいずれかに変換します
いくつかのフラット ファイル形式。 このプログラムは非推奨のインターフェースを中心に構築されています。 お願いします
つかいます asn2gb(1) を代わりにお使いください。
OPTIONS
オプションの概要は以下に含まれています。
- 使用状況メッセージを印刷する
-A X で始まる地域を表示 X （デフォルトは0）
-B X で終わる地域を表示 X (デフォルトは最後の位置です)
-C バンキットのコメントを表示
-G 出力は、ゲノム ビューのみで XNUMX つのトップ bioseq です
-L F 古い (Genbank 127.0 より前の) LOCUS ライン形式を使用する
-M 出力はマップ bioseqs のみです
-R GenBank リリースの場合
-V F バージョンを使用しないでください
-a ファイル名
ASN.1 入力のファイル名 (デフォルトは stdin)
-b バイナリモードでasnfileを入力します
-d SeqMgr インデックスを使用する
-e 入力はSeqエントリです
-f b/p/e/s/x/z
出力フォーマット：
b GenBank (デフォルト)
ゲンペプト
EMBL
■疑似EMBL
×GenBankSelect
EMBLPEPT
-g 技番号を表示
-h F シーケンスを非表示
-k F 複雑なセット (phy-set、mut-set、pop-set) を使用しないでください
-l ファイル名
エラーをログに記録する ファイル名
-m r/d/s/c/k/l/e/p
出力モード：
r リリース (デフォルト)
d ダンプ
sスパンコール
c クロモスコープ
k dir サブデバッグ
l ディレクトリサブ
改訂する
p 部分レポート
-n F 厳密な遺伝子バインディング
-o ファイル名
出力ファイル名 (デフォルトは stdout)
-p F 新しい遺伝子の特徴を省略する
-q 出力は XNUMX つの上位 bioseq のみです
-r ファイル名
出力エラー ログ ファイル (デフォルトは stderr)
-s 入力はSeq送信です
-t 詳細なメッセージ テキストを表示する
-v F エラーメッセージを抑制する
-w HTML 出力形式を使用する
-y ヘルプ形式のみを印刷
-z 組織名の新しいアルゴリズム
onworks.net サービスを使用してオンラインで asn2ff を使用する
