これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bowtieXNUMX-inspect です。
プログラム：
NAME
bowtie2-inspect - bowtie2-inspect-* インデックスのラッパー
SYNOPSIS
bowtie2-検査 [オプション]*
DESCRIPTION
ベン・ラングミードによるボウタイ2バージョン2.2.6（[メール保護]、www.cs.jhu.edu / 〜langmea）
bt2ファイル名から末尾の.1.bt2 / .2.bt2を引いたもの
デフォルトでは、インデックス付きヌクレオチド配列のFASTAレコードを標準に出力します
アウト。 と -n、名前を出力するだけです。 と -s、インデックスの概要を出力するだけです
パラメータとシーケンス。 と -e、該当する場合は色を保持します。
OPTIONS
--大きなインデックス
「小さい」インデックスが存在する場合でも、「大きい」インデックスの検査を強制します。
-a/ - 横切って
FASTA出力の文字数（デフォルト：60）
-n/-名前
参照配列名のみを印刷する
-s/ - まとめ
要約を含む印刷参照名、長さ、インデックスプロパティ
-e/-bt2-ref
.bt2から参照を再構築します（遅く、色を保持します）
-v/-詳細
詳細出力（デバッグ用）
-h/ - ヘルプ
ツールとそのオプションの詳細な説明を印刷する
- 助けて この使用法メッセージを印刷する
onworks.net サービスを使用してオンラインで bowtie2-inspect を使用する
