これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bp_multi_hmmsearch.plp です。
プログラム:
NAME
multi_hmmsearch - を使用して、複数の FASTA ファイルに対して hmmsearch を実行します。
INDEX ファイル
SYNOPSIS
multi_hmmsearch -p hmm_file [-i] -f インデックスファイル
DESCRIPTION
これは Bioperl または Bioperl-run を使用しないため、技術的には Bio::Tools::Run スクリプトではありません。
コンポーネントですが、便利です。
必須の オプション:
-p 検索に使用する HMM プロファイル。
-f 複数の FASTA ファイルのリストを含む INDEX ファイル
検索。
スペシャル オプション:
-i 結果の hmms ファイルで新しいインデックス ファイルを作成します。 これは
このリストを入力引数として渡したい場合に便利です。
別のプログラム。
-h このドキュメントを表示します。
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バグをBioperlバグ追跡システムに報告して、バグとそのバグを追跡できるようにします。
解像度。 バグレポートはWeb経由で送信できます。
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
onworks.net サービスを使用して bp_multi_hmmsearch.plp をオンラインで使用する