これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド bp_run_neighbor.plp です。
プログラム:
NAME
run_neighbor - Bioperl を介して Phylip の「隣人」プログラムを実行する
SYNOPSIS
run_neighbor [-i 入力ファイル] [-o 出力ファイル名]
DESCRIPTION
ネイバーを実行するマトリックス ファイルを提供します。 ファイルは file.matrix の形式で名前を付ける必要があります
または file.protdist (末尾は重要ではありませんが、プログラムは次の形式のファイルを想定しています。
(\S+)\.(\S+)。
これにより、アプリケーション「neighbor」が実行され、タンパク質から Neighbor-Joining ツリーが構築されます。
距離行列。
onworks.net サービスを使用して bp_run_neighbor.plp をオンラインで使用する