これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド deltaXNUMXmaf です。
プログラム：
NAME
delta2blocks-mugsyのパッチからアライメントの並べ替えまでのmummer用の追加ツール
delta2maf-mugsyのパッチからアライメントの並べ替えまでのmummer用の追加ツール
SYNOPSIS
デルタ2ブロック [オプション]<参照ID><qryID>
デルタ2MAF [オプション]<参照ID><qryID>
DESCRIPTION
-h ヘルプ情報を表示する
-q クエリの開始座標で線形を並べ替える
-r 参照開始座標で線形を並べ替える
-w int画面幅を設定します-デフォルトは60です
-x int行列タイプを設定します-デフォルトは2（BLOSUM 62）、他のオプションには1（BLOSUM 45）が含まれます
および3（BLOSUM 80）
注：アミノ酸配列にのみ影響します
入力は、渡された「nucmer」または「promer」プログラムのいずれかの.delta出力です。
コマンドライン。
出力はstdoutであり、クエリと参照の間のすべての配置で構成されます
コマンドラインで識別されるシーケンス。
注：デフォルトでは並べ替えは行われないため、配置は次のように並べ替えられます。
NS 入力。
onworks.net サービスを使用してオンラインで delta2maf を使用する
