これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドダイジェストです。
プログラム：
NAME
ダイジェスト-タンパク質タンパク質分解酵素または試薬切断部位に関するレポート
SYNOPSIS
ダイジェスト -セコール セコール -mwdata データファイル -メニュー リスト -単核症 ブール値 -不利 ブール値
-下級生いじめ ブール値 -ターミニ リスト -オーバーラップ ブール値 -すべての部分 ブール値
-outfile レポート
ダイジェスト -助けて
DESCRIPTION
ダイジェスト EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「Protein：Motifs」コマンドグループの一部です。
OPTIONS
入力
-セコール セコール
-mwdata データファイル
アミノ酸の分子量データデフォルト値：Emolwt.dat
必須
-メニュー リスト
デフォルト値：1
-単核症 ブール値
デフォルト値：N
高機能
-不利 ブール値
トリプシンは通常、「KRIFLP」のいずれかが後に続く場合、「KR」の後にカットされません。
Lys-Cは、通常、「K」の後に「P」が続く場合、「K」の後にカットされません。 Arg-Cはしません
通常、「R」の後に「P」が続く場合は、「R」の後にカットします。 V8-bicarbは通常、
「KREP」のいずれかが後に続く場合は「E」。 V8-ホスフは通常、「DE」の後に切断されません。
その後に「P」が続きます。 キモトリプシンは通常、「FYWLM」の後に切断されません。
その後に「P」が続きます。 不利なものを指定すると、これらの不利なカットと
好きなもの。
-下級生いじめ ブール値
半特異的および非特異的消化を可能にします。 このオプションは特に便利です
を使用してタンパク質を同定するためのペプチド配列のリストを生成するため
質量分析。
-ターミニ リスト
デフォルト値：1
出力
-オーバーラップ ブール値
部分消化に使用されます。 お気に入りのカットサイトからのすべてのカットに加えて、1..3、2..4、
3..5などですが（例）2..5ではありません。 したがって、オーバーラップはXNUMXつだけのフラグメントです。
その中の潜在的なカットサイト。
-すべての部分 ブール値
オーバーラップに関しては、複数の潜在的なカットサイトを含むフラグメントが含まれます。
-outfile レポート
onworks.netサービスを使用してオンラインでダイジェストを使用する
