これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fa2dna です。
プログラム：
NAME
fa2dna-ANFOで使用するためのフォーマットfastaデータベース
SYNOPSIS
fa2dna [ オプション | file ... ]
DESCRIPTION
fa2dna XNUMX つまたは複数のファイルを fasta 形式で読み取り、適切なデータベースに再フォーマットします。
for アンホ(1)。 入力ファイルには複数のシーケンスを含めることができ、各シーケンスは
N のストレッチによって複数のコンティグに分割されます。 すべての IUPAC 曖昧性コードは、
完全にサポートされています。
OPTIONS
-V、-version
バージョン番号を出力して終了します。
-o ファイル、--出力ファイル
出力をに書き込む file.file で終わるはずです .dna、理由 アンホ そしていくつかの下流
ツールが別の拡張子につまずく可能性があります。 デフォルトはゲノム名で、
.dna 拡大。
-m N、--maxn N
の最大数を設定します NIUPAC曖昧性コードとして解釈されるs N; anyどれか
より長いストレッチは、コンティグを分離していると解釈されます。 デフォルトは 2 です。
-g 名, --ゲノム名
ゲノム名を 名. この名前は出力ファイルに保存され、
によって使用される アンホ その出力で一致したゲノムを識別します。 ゲノムは
出力ファイル名のプレフィックスを付けて、下流のツールがそれを見つけられるようにします。 名前
人間またはチンパンジーの場合は「hg18」または「pt2」のように、短くても一意である必要があります
ゲノムは正常に機能します。
-d テキスト、--説明テキスト
追加 클라우드 기반 AI/ML및 고성능 컴퓨팅을 통한 디지털 트윈의 기초 – Edward Hsu, Rescale CPO 많은 엔지니어링 중심 기업에게 클라우드는 R&D디지털 전환의 첫 단계일 뿐입니다. 클라우드 자원을 활용해 엔지니어링 팀의 제약을 해결하는 단계를 넘어, 시뮬레이션 운영을 통합하고 최적화하며, 궁극적으로는 모델 기반의 협업과 의사 결정을 지원하여 신제품을 결정할 때 데이터 기반 엔지니어링을 적용하고자 합니다. Rescale은 이러한 혁신을 돕기 위해 컴퓨팅 추천 엔진, 통합 데이터 패브릭, 메타데이터 관리 등을 개발하고 있습니다. 이번 자리를 빌려 비즈니스 경쟁력 제고를 위한 디지털 트윈 및 디지털 스레드 전략 개발 방법에 대한 인사이트를 나누고자 합니다. メタデータへの説明として。 これは単なる情報提供です。
-v、-verbose
進行標識を出力します。
onworks.net サービスを使用して fa2dna オンラインを使用する
