これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fastatool です。
プログラム:
NAME
ファストツール - 提供 a セッションに of 豊富なツール群 便利 いつ ワーキング ファスタ ファイル。
DESCRIPTION
このプログラムは MIRA アセンブラ パッケージの一部です。 Fastatool は一連のツールを提供します
FASTA トレース ファイルを操作する場合に便利です。
詳細については、以下のドキュメントをご確認ください。
あらすじ」
ファストツール <ツール パラメータ>
OPTIONS
Clip FASTA シーケンスの左右の塩基をクリップし、結果を STDOUT に書き込みます。
使用法:
ClipFASTA -l leftclip -r rightclip fastainfile
消毒する
非 IUPAC 塩基を持つシーケンスまたは空のシーケンスを FASTA ファイルから削除し、書き込みます
「生き残った」シーケンスを新しいファイルにコピーします。 高品質のファイルが提供された場合、クリーンなファイルが提供されます。
そのバージョンも書かれています。 品質ファイル内のシーケンス (指定されている場合)
fasta ファイルと同じ順序でなければなりません。
使用法:
sanitizeFASTA fastainfile fastaoutfile [fastaqualin fastaqualoutfile]
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastatool を使用する