これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fastq_quality_filter です。
プログラム：
NAME
fastq_quality_filter - 品質に基づいてシーケンスをフィルタリングします
DESCRIPTION
使用法: fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] の一部
FASTX ツールキット 0.0.14 (A. Gordon 著)[メール保護])
[-h] =この役立つヘルプ画面。
[-q N] = 維持する最小品質スコア。
[-p N] = [-q] 品質を持つ必要がある塩基の最小パーセント。
[-z] = GZIP を使用して出力を圧縮します。
[-i インファイル]
= FASTA / Q入力ファイル。 デフォルトはSTDINです。
[-o OUTFILE] = FASTA/Q 出力ファイル。 デフォルトはSTDOUTです。 [-v] = 詳細 -
シーケンスの数を報告します。
[-o]を指定した場合、
レポートは STDOUT に出力されます。
[-o] が指定されていない場合 (出力は STDOUT に送られます)、レポートは次の場所に出力されます。
標準偏差。
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastq_quality_filter を使用する
