これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド fastq_to_fasta です。
プログラム：
NAME
fastq_to_fasta - FASTQ ファイルを FASTA ファイルに変換します
DESCRIPTION
使用法: fastq_to_fasta [-h] [-r] [-n] [-v] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] FASTX の一部
ツールキット 0.0.14 by A. Gordon ([メール保護])
[-h] =この役立つヘルプ画面。
[-r] = シーケンス識別子の名前を数字に変更します。
[-n] = 未知の (N) ヌクレオチドを含む配列を保持します。
デフォルトでは、そのようなシーケンスは破棄されます。
[-v] = Verbose - シーケンスの数を報告します。
[-o]を指定した場合、
レポートは STDOUT に出力されます。
[-o] が指定されていない場合 (出力は STDOUT に送られます)、レポートは次の場所に出力されます。
標準偏差。
[-z] = GZIP を使用して出力を圧縮します。
[-i インファイル]
= FASTA / Q入力ファイル。 デフォルトはSTDINです。
[-o OUTFILE] = FASTA 出力ファイル。 デフォルトはSTDOUTです。
onworks.net サービスを使用してオンラインで fastq_to_fasta を使用する
