これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド gmx-eneconv です。
プログラム:
NAME
gmx-eneconv - エネルギー ファイルを変換する
SYNOPSIS
gmx エネコン [-f [<.edr> [...]]] [-o [<.edr>]] [-b ] [-e ]
[-DT ] [-オフセット ] [-[いいえ]設定時間] [-[いいえ]並べ替え]
[-[いいえ]rmdh] [-スケールファク ] [-[いいえ]エラー]
DESCRIPTION
の試合に ファイル に指定された -f オプション:
複数のエネルギー ファイルをソートされた順序で連結します。 ダブルタイムフレームの場合、
後のファイルにあるものが使用されます。 指定することで -settime 開始時間を聞かれます
各ファイルの。 入力ファイルはコマンド ラインから取得されます。たとえば、 GMX
エネコンブ -f *.edr -o 固定.edr トリックを行う必要があります。
XNUMXつ file のために指定された -f:
XNUMX つのエネルギー ファイルを読み取り、別のエネルギー ファイルを書き込み、 -DT, -オフセット, -t0 & -settime
オプションを使用し、必要に応じて別の形式に変換します (ファイル拡張子で示されます)。
-settime が最初に適用され、次に -DT/-オフセット 続い -b & -e どのフレームを選択するか
書くために。
OPTIONS
入力ファイルを指定するオプション:
-f [<.edr> [...]] (ener.edr)
エネルギーファイル
出力ファイルを指定するオプション:
-o [<.edr>] (修正.edr)
エネルギーファイル
その他のオプション:
-b (-1)
初めて使用する
-e (-1)
最後に使用した時間
-DT (0)
t MOD dt = オフセットの場合のみフレームを書き出す
-オフセット (0)
時間オフセット -DT オプション
-[いいえ]設定時間 (いいえ)
開始時間を対話的に変更する
-[いいえ]並べ替え (はい)
エネルギー ファイル (フレームではない) を並べ替えます
-[いいえ]rmdh (いいえ)
フリーエネルギーブロックデータを削除する
-スケールファク (1)
エネルギー成分にこの係数を乗算します
-[いいえ]エラー (はい)
ファイル内のエラーで停止する
KNOWN 問題
· 軌跡を結合するとき、シグマと E^2 (統計に必要) は更新されません
正しく。 実際のエネルギーのみが正しいのです。 したがって、統計を計算する必要があります。
別の方法。
onworks.net サービスを使用してオンラインで gmx-eneconv を使用する