これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド hmmconvert です。
プログラム：
NAME
hmmconvert - プロファイル ファイルを HMMER 形式に変換します
SYNOPSIS
うーん変換 [オプション]
DESCRIPTION
うーん変換 ユーティリティは、入力プロファイル ファイルをさまざまな HMMER 形式に変換します。
デフォルトでは、入力プロファイルは古い形式や廃止された形式を含む任意の HMMER 形式にすることができます。
HMMER2、ASCII、またはバイナリから。 出力プロファイルは現在の HMMER3 ASCII 形式です。
'-'（ダッシュ）の場合があります。これは、この入力をから読み取ることを意味します。 stdin ファイルではなく。
OPTIONS
-h ヘルプ; コマンドラインの使用法と利用可能なすべてのオプションの簡単なリマインダーを印刷します。
-a プロファイルをASCIIテキスト形式で出力します。 これがデフォルトです。
-b プロファイルをバイナリ形式で出力します。
-2 レガシー HMMER2 ASCII テキスト形式、ls (グローカル) モードで出力します。 これにより、HMMER3 が可能になります。
比較のために、モデルは HMMER2 の近似値に再変換されます。
研究。
--outfmt
最新以外の HMMER3 ASCII テキスト形式で出力します。 有効
の選択肢 3/a ～ 3/f です。 現在の形式は 3/f で、これは
デフォルト。 形式 3/b は公式 HMMER3 リリースで使用され、その他の形式は
さまざまなテスト バージョンで使用されました。
onworks.net サービスを使用してオンラインで hmmconvert を使用する
