これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドilinkです。
プログラム：
NAME
ilink-シータベクトルの局所的に最適な値を見つけるためのGEMINI最適化手順
組換え画分の
SYNOPSIS
ILINK [オプション] ipedfile.dat pedfile.dat
DESCRIPTION
このマニュアルページでは、 ILINK 指図。 実際、これは非常に生の意図です
Debian GNU / Linuxディストリビューションでは、各プログラムに次のことを要求するため、マンページを提供します。
マンページがあります。 どんな強化も大いに評価されるでしょう。
ILINK の一部です。 ファストリンク ソフトウェアパッケージ。
ILINKは、GEMINI最適化手順を使用して、シータの局所的に最適な値を見つけます
組換え画分のベクトル。 lcpによって生成されたデフォルトのスクリプトを使用する場合、
シータの初期推定値は、すべての次元で.1です。 GEMINIは、各シータを次のように評価します
尤度、より高い血統尤度を持つシータベクトルを見つけようとします。
GEMINIプロシージャには、複数の反復があります。 各反復は、次のXNUMX行に対応します。
出力。 各反復には、複数の尤度関数の評価が含まれます。 各反復
XNUMXつのフェーズがあります。 フェーズIでは、GEMINIは現在の最高のシータを改善しようとします。 フェーズIIでは、
GEMINIは、現在の最良のシータに関する尤度の勾配を推定します
ベクター。 最初の反復では、フェーズIは最初の可能性のみを評価します
シータ候補。
ILINKが次のような行を出力すると、maxcensorは-32767に減らすことができ、完了しました。
最初の尤度関数の評価。 長期的には、この事実を使用して見積もりを行うことができます
実行時間。 関数評価の数の妥当な概算は次のとおりです。
10 *（シータベクトルの次元数）。 シータベクトルの次元数は次のとおりです。
ほとんどの場合、遺伝子座の数よりXNUMXつ少なくなります。 マレシータと女性シータが許可されている場合
異なる場合（sexdifが1に設定されている場合）、次元数は2倍のXNUMX *（
遺伝子座-1）。 （fitmodelをtrueに設定して）他のパラメーターを推定すると、
次元数。
の詳細については ILINK ファイルを読むと便利かもしれません
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK Debian GNU / Linuxシステムを使用している場合。
OPTIONS
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