これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド indigo-cano です。
プログラム:
NAME
indigo-cano - MOL または SDF 形式で標準的な SMILES または分子の階層化コードを生成します
SYNOPSIS
インディゴカノ ファイル名.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [パラメータ]
インディゴカノ - SMILES [パラメータ]
DESCRIPTION
インディゴカノ 正規の SMILES または MOL の分子の階層化コードを生成するために使用されます。
SDF形式。
OPTIONS
インディゴカノ 標準入力にファイルまたは SMILES コードが必要です。
その後に次の XNUMX つ以上のパラメータが続きます。
-笑顔
正規 SMILES を出力 (デフォルト)
-レイヤード
正規の階層化コードを出力する
id
SDF ファイル内の指定された名前の ID フィールド
-ノーアロマ
分子を芳香化しない
-四面体なし
四面体の立体中心を無視する
-シストランスなし
シス-トランス結合情報を無視する
例
インディゴカノ infile.sdf
インディゴカノ infile.sdf.gz id モレグノ > 結果.txt
インディゴカノ infile.smi -レイヤード -シストランスなし
インディゴカノ - 「NC1C=CC(O)=CC=1」
onworks.net サービスを使用してオンラインで indigo-cano を使用する