これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド mafXNUMXanchors.pl です。
プログラム：
NAME
maf2anchors -- maf ファイルを Murasaki アンカー セットに変換します
SYNOPSIS
maf2アンカー
OPTIONS
--prefix=
出力ファイル名のプレフィックスとして使用します (それ以外の場合は、 )
--亀裂=
亀裂までは許容します。
--fakeseqs
シーケンス長データに基づいて偽のシーケンス長ファイルとシーケンス スタブを生成する
MAFファイル内
- 信頼
TBA によってファイルの XNUMX 行目に追加されたコメント注釈を信頼します (存在する場合)。
アラインメントに使用されたツリーと関連するすべての配列がリストされていることがわかります。 デフォルト
オンに。 --notrust を使用して TBA タグを信頼しません (技術的には、このデータは
ファイル形式の仕様に基づいており、TBA が生成するコメントに詰め込まれているだけですが、
すべての MAF ファイルに存在しない、または正確ではない可能性があるため、次のオプションを提供します。
不信感を抱きます）。
- 選別
--trust で見つかったシーケンスを並べ替えます (出力と一致するように)。
--notrust で発生しました)。
onworks.net サービスを使用してオンラインで maf2anchors.pl を使用する
