これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドmasai_output_peです。
プログラム：
NAME
masai_output_pe-マサイ出力-ペアエンドモード
SYNOPSIS
masai_output_pe [オプション]
DESCRIPTION
マサイ族は、おおよそのシードと複数のシードに基づく高速で正確な読み取りマッパーです。
バックトラック。
見る http://www.seqan.de/projects/masai 。
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-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示します。
- バージョン
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ペアリングオプション：
-ng, -ギャップなし
読み取りをギャップに合わせないでください。
-NS, --ライブラリの長さ NUM
ライブラリの長さ。 デフォルト：220。
-LE, --ライブラリエラー NUM
ライブラリの長さの許容範囲。 デフォルト：50。
出力オプション：
-t, --tmp フォルダー STR
巨大な一時フォルダを指定します。 デフォルト：ゲノムフォルダーを使用します。
-o, -出力ファイル FILE
出力ファイルを指定します。 デフォルト：読み取りファイル名プレフィックスを使用します。 有効なファイルタイプ
生とサムです。
-nc, -葉巻なし
CIGAR文字列を出力しません。 これはSAM出力にのみ影響します。
デバッグオプション：
-NS, --ノーダンプ
結果をダンプしないでください。
VERSION
masai_output_peバージョン：0.7.1 [14053]最終更新日2013-05-16
onworks.netサービスを使用してオンラインでmasai_output_peを使用する
