これはコマンド mia-2dmyocard-ica で、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できます。
プログラム：
NAME
mia-2dmyocard-ica - 一連の 2D 画像に対して ICA 解析を実行します。
SYNOPSIS
mia-2dmyocard-ica -i [オプション]
DESCRIPTION
mia-2dmyocard-ica このプログラムは、一連の心筋灌流で ICA を実行するために使用されます。
画像による動き補正に使用できる合成参照を作成するための画像
登録。 完全な動き補償を実行することが目的の場合は、次のように作成することをお勧めします。
セグメンテーション セットを作成し、mia-2dmyoica-nonrigid を使用します。 入力データが
セグメンテーション セットを使用すると、mia-2dmyocard-icaseries も使用できます。 このプログラムは
基本的に、参照イメージ用の ICA を実行する方法に関するさまざまなオプションをテストするために使用されます。
創作。
OPTIONS
-i --in-base=(入力、必須); イオ
下記パターン名の入力ファイル名XXXX.ext X=数字 対応ファイルの場合
タイプについては、PLUGINS:2dimage/io を参照してください。
--coefs=
ミキシング係数をこのファイルに出力します
-o --out-base=(出力); 弦
出力ファイル名ベース
-t --type=exr
出力ファイルの種類
サポート 値 は：（ @, BMP、 DCM、 EXR、 JPEG、 JPG、 PNG、 生、
ティフ、 TIFF、 V, ビスタ、 bmp、 dcm、 例、 jpeg、 jpg、 png、 生、 tif、
ティフ、 v, 意見、 )
-k --スキップ=2
シリーズの冒頭で画像をスキップ シリーズの冒頭で画像をスキップ
-e --end=60
シリーズの最後の画像 シリーズの最後の画像
-C --コンポーネント=0
番号コンポーネントの数、0=自動的に推定nr。 コンポーネントの数、0=推定値
自動的に
-m --ストリップ平均
シリーズから平均画像を取り除く
-f --save-features=
アイキャッチ画像を保存する
-p --strip-periodic
周期成分のみを除去する
-x --max-ica-iterations=0
ICA ソルバーの最大反復数ICA ソルバーの最大反復数
-n --ica-normalize
ica_normalize フィーチャ画像
--すべての機能=
すべてのアイキャッチ画像を保存する
-L --LV-クロップアンプ=0
LV クロップ マスクの増幅、0.0 = クロップしないLV クロップ マスクの増幅、0.0
= トリミングしないでください
-a --auto-components
相関関係に基づいたコンポーネント数の自動推定。 暗示する
-m および -n (実験的)
カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する
-著作権
著作権情報を印刷する
-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する
-? - 使用法
短いヘルプを印刷する
- バージョン
バージョン番号を出力して終了します
処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。
プラグイン: 2D画像/IO
bmpファイル BMP 2D 画像入出力サポート
認識されるファイル拡張子: .BMP、.bmp
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット
データプール 内部データプールとの間の仮想IO
認識されるファイル拡張子: .@
ディコム DICOM用の2D画像io
認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm
サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット
元 OpenEXR 画像用の 2dimage io プラグイン
認識されるファイル拡張子: .EXR、.exr
サポートされている要素タイプ:
符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット
JPG JPEGグレースケール画像用の2dimage ioプラグイン
認識されるファイル拡張子: .JPEG、.JPG、.jpeg、.jpg
サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット
PNG PNG画像用の2dimage ioプラグイン
認識されるファイル拡張子: .PNG、.png
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット
生 RAW 2D画像出力対応
認識されるファイル拡張子: .RAW、.raw
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
TIF TIFF 2D画像入出力サポート
認識されるファイル拡張子: .TIF、.TIFF、.tif、.tiff
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号なし8ビット、符号なし16ビット、符号なし32ビット
ビスタ Vista 画像用の 2dimage io プラグイン
認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista
サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット
実施例
画像 imageXXXX.exr からの合成参照を評価し、refXXXX.exr に保存します。
2 つの独立したコンポーネントを使用することで、XNUMX つの画像の除去、正規化、スキップを意味します。
mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n
著者
ガート・ウォルニー
COPYRIGHT
このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
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GENERAL PUBLIC LICENSE バージョン 3 (またはそれ以降)。 詳細については、次のコマンドを使用してプログラムを実行してください。
オプション「--copyright」。
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