mia-3dfluid - クラウドでオンライン

プログラム：

NAME

mia-3dfluid - 流体動的 3D レジストレーション

SYNOPSIS

mia-3d流体 -i -r -o [オプション]

DESCRIPTION

mia-3d流体 このプログラムは、流体力学に基づく非剛体登録に使用されます。
で説明: Wollny、G. と Kruggel、F.、「非剛体登録の計算コスト」
流体力学に基づくアルゴリズム」、IEEE Transactions on Medical Imaging、 11(8)、pp。
946-952, 2002, doi:10.1109/TMI.2002.803113. SSDを唯一の登録として使用します
基準。

OPTIONS

ファイル-IO
-i --in-image=(入力、必須); イオ
入力画像 サポートされているファイル タイプについては、PLUGINS:3dimage/io を参照してください。

-r --ref-image=(入力、必須); イオ
参照画像 サポートされているファイル タイプについては、PLUGINS:3dimage/io を参照してください。

-o --out-transformation=(出力、必須); いお
登録変換フィールドを含む出力変換
サポートされているファイル タイプは PLUGINS:3dtransform/io を参照してください

-d --out-image=(出力); いお
変形した画像を保存する サポートされているファイルの種類については、PLUGINS:3dimage/io を参照してください

カスタマーサービス & インフォ
-V --verbose=警告
出力の冗長性、指定されたレベルおよびより高い優先順位のメッセージを出力します。
最も低いレベルから始まるサポートされる優先度は次のとおりです。
info ‐ 低レベルのメッセージ
トレース ‐ 関数呼び出しトレース
失敗する ‐ テストの失敗を報告する
警告 ‐ 警告
エラー ‐ エラーを報告する
debug ‐ デバッグ出力
メッセージ ‐ 通常のメッセージ
致命的な ‐ 致命的なエラーのみを報告する

-著作権
著作権情報を印刷する

-h --ヘルプ
このヘルプを印刷する

-? - 使用法
短いヘルプを印刷する

- バージョン
バージョン番号を出力して終了します

処理
--スレッド=-1
処理に使用するスレッドの最大数。この数は小さくする必要があります。
またはマシン内の論理プロセッサ コアの数と同じです。 (-1:
自動推定)。処理に使用するスレッドの最大数。これは
数は、論理プロセッサ コアの数以下である必要があります。
この機械。 (-1: 自動推定)。

参加申し込み パラメータ
--マルチグリッドを無効にする
マルチグリッド処理を無効にする

--disable-fullres
フル解像度の画像の処理を無効にする

--ラムダ=1
弾性定数弾性定数

--mu=1
弾性定数弾性定数

-s --start-size=16
マルチグリッドの初期サイズマルチグリッドの初期サイズ

-m --method=sora
PDE を解く方法
SOR ‐ 過弛緩の連続
ソーラ ‐ Gauss Southwell 緩和

--ステップ=0.8
初期ステップサイズ初期ステップサイズ

-p --interpolator=bspline:d=3
画像補間カーネル画像補間カーネル サポートされているプラ​​グインの場合
PLUGINS:1d/splinekernel を参照してください。

--リラックス=1
過緩和係数 vor メソッド sor過緩和係数 vor メソッド sor

--maxiter=10
最大反復最大反復

--ε=0.01
切り捨て条件切り捨て条件

--matter=4
実在物質が想定される（実験的）強度以上の強度
どの実体が想定されているか (実験的)

プラグイン: 1d/スプラインカーネル

bスプライン B スプライン カーネルの作成、サポートされているパラメータは次のとおりです。

d = 3; [0, 5] の整数
スプライン次数。

オモン OMoms-spline カーネルの作成、サポートされているパラメーターは次のとおりです。

d = 3; [3, 3] の整数
スプライン次数。

プラグイン: 3D画像/IO

分析します 7.5画像を分析する

認識されるファイル拡張子: .HDR、.hdr

サポートされている要素タイプ:
符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号付き 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、
浮動小数点64ビット

データプール 内部データプールとの間の仮想IO

認識されるファイル拡張子: .@

ディコム 3D としての Dicom 画像シリーズ

認識されるファイル拡張子: .DCM、.dcm

サポートされている要素タイプ:
符号付き16ビット、符号なし16ビット

HDF5 HDF5 3D画像IO

認識されるファイル拡張子: .H5、.h5

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点
小数点32ビット、浮動小数点64ビット

インリア インリア画像

認識されるファイル拡張子: .INR、.inr

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

MHD MetaIO VTK 実装を使用した 3D 画像 IO (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .MHA、.MHD、.mha、.mhd

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

気の利いた NIFTI-1 3D画像IO

認識されるファイル拡張子: .NII、.nii

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、符号付き 64 ビット、符号なし 64 ビット、浮動小数点 32
ビット、浮動小数点64ビット

VFF VFF Sun ラスター形式

認識されるファイル拡張子: .VFF、.vff

サポートされている要素タイプ:
符号なし8ビット、符号付き16ビット

ビスタ 3Dビュー

認識されるファイル拡張子: .V、.VISTA、.v、.vista

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

vti 3D 画像 VTK-XML の入力および出力 (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .VTI、.vti

サポートされている要素タイプ:
符号付き 8 ビット、符号なし 8 ビット、符号付き 16 ビット、符号なし 16 ビット、符号付き 32
ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64 ビット

VTK 3D VTK 画像のレガシー入力および出力 (実験的)。

認識されるファイル拡張子: .VTK、.VTKIMAGE、.vtk、.vtkimage

サポートされている要素タイプ:
バイナリデータ、符号付き8ビット、符号なし8ビット、符号付き16ビット、符号なし16ビット、
符号付き 32 ビット、符号なし 32 ビット、浮動小数点 32 ビット、浮動小数点 64
ビット

プラグイン: 3D変換/io

BBS 3D 変換のバイナリ (移植性のない) シリアル化 IO

認識されるファイル拡張子: .bbs

データプール 内部データプールとの間の仮想IO

認識されるファイル拡張子: .@

ビスタ 3D 変換の Vista ストレージ

認識されるファイル拡張子: .v、.v3dt

XML 3D 変換の XML シリアル化 IO

認識されるファイル拡張子: .x3dt

実施例

画像 test.v を画像 ref.v に登録し、変形ベクトル フィールド regfield.v を書き込みます。
16 ピクセル以上の最小サイズで登録を開始します。

mia-3dfluid -i test.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

著者

ガート・ウォルニー

COPYRIGHT

このソフトウェアの著作権は 1999-2015 ライプツィヒ、ドイツおよびマドリード、スペインにあります。 来る
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オプション「--copyright」。

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