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newicktops - クラウドでオンライン

Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、または MAC OS オンライン エミュレーターを介して、OnWorks の無料ホスティング プロバイダーで newicktops を実行します。

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド newicktops です。

プログラム:

NAME


njplot - 生物学者のための系統樹描画プログラム newicktops - 系統樹の描画
ツリーを PostScript ファイルに取り込む

SYNOPSIS


njplot [オプション] ツリーファイル

ニューウィックトップ [オプション] ツリーファイル

newicktotxt [オプション] ツリーファイル

DESCRIPTION


このマニュアルページでは、 njplot

当学校区の ニューウィックトップ このコマンドはまったく同じことを行いますが、X11 ディスプレイは必要ありません。 出力は
PostScript ファイルにレンダリングされます。

当学校区の newicktotxt コマンドは次とまったく同じことを行います ニューウィックトップ しかし、出力はレンダリングされます
テキストファイルに。

このマニュアル ページは、Debian GNU/Linux ディストリビューション用に書き直されました。
プログラムにはマニュアルページがありません。

njplot 任意のバイナリまたは多分岐ツリーを描画できるツリー描画プログラムです。
標準の系統樹形式 (たとえば、PHYLIP パッケージで使用される形式) で。
NJplot は、倹約から得た根のない木を根付かせるのに特に便利です。
距離または最尤ツリー構築方法。

ルート化されていないツリーのルート化は、マウスを使用して対話的に指定できます。 NJプロット
ズーム、ブランチの交換、ブートストラップ スコアの表示、ファイルへの保存も可能です。
ポストスクリプト形式。 したがって、NJplot は、任意のパッケージのグラフィカル拡張機能として使用できます。
ツリーを保存するために標準ツリー形式を使用する系統発生プログラム (つまり、
ほとんどのそのようなパッケージで)。

OPTIONS


x ターミナル エミュレータでのみ動作する次のオプションのみがあり、x ターミナル エミュレータでは動作しません。
コンソールモード:

-h 簡単なヘルプを出力します。

-我ら US Letter 用紙サイズ用に用意された Postscript ツリー ファイル。

-psonly
ウィンドウ インターフェイスはなく、PostScript ツリー ファイルを記述するだけです。

-サイズ n
分類群名に使用されるフォント サイズ n。

-pc n PostScript 出力のページ数。

-psize 幅×高さ
WIDTHxHEIGHT で表される PostScript ページのサイズ。

-長さ
ツリー ファイルに表示される場合は、枝の長さを表示します。

-ブート ブートストラップ値がツリー ファイルに表示される場合は、ブートストラップ値を表示します。

-無題
PostScript 出力にはタイトルを含めないでください。

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