これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの XNUMX つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド obenergy です。
プログラム：
NAME
エネルギー — 分子のエネルギーを計算する
SYNOPSIS
エネルギー [OPTIONS] ファイル名
DESCRIPTION
obenergy ツールを使用して、（複数）分子内の分子のエネルギーを計算できます。
ファイル (例: MOL2 など)
OPTIONS
ファイル名が指定されていない場合、obenergy は利用可能な力フィールドを含むすべてのオプションを提供します。
-v 詳細: 個々のエネルギー相互作用をすべて出力します。
-ff フォースフィールド
力場を選択します
例
利用可能な力場を含む、可能なオプションを表示します。
エネルギー
ファイル test.mol2 内の分子のエネルギーを計算します。
オエネルギーテスト.mol2
物理力場を使用して、ファイル test.mol2 内の分子のエネルギーを計算します。
obenergy -ff 化学的テスト.mol2
ファイル test.mol2 内の分子のエネルギーを計算し、すべての個別のエネルギーを出力します。
エネルギー相互作用:
obenergy -v test.mol2
onworks.net サービスを使用してオンラインで obenergy を使用する
