これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなど、複数の無料オンライン ワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド seqsplit です。
プログラム：
NAME
seqsplit - seq を定義されたサイズのチャンクに分割し、オーバーラップする
SYNOPSIS
シーケンス分割 [-オプション]
DESCRIPTION
このマニュアルページでは、 シーケンス分割
シーケンス分割 シーケンスを定義されたサイズの小さなチャンクに分割し、
オーバーラップ; FASTA ファイルを出力します。
OPTIONS
-h ヘルプ; 使用状況とバージョンを表示します。
-o
新しい FASTA ファイルを.
--fragfile
フラグメントごとに XNUMX 行の coord サマリー ファイルを保存します。 .
--informat
配列ファイル形式を指定します。
- 長さ
一意の各 seq フラグメントの最大長を次のように設定します.
--オーバーラップ
オーバーラップの長さを(フラグメントの合計サイズ = 長さ + オーバーラップ)。
--ショートネーム
" ではなく、短い "frag1" 名を使用してください/ - "。
制限
引き続き 32 ビットで動作します。サイズが 2 GB を超えるシーケンスはありません。
onworks.net サービスを使用してオンラインで seqsplit を使用する
