これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドTransDecoder.LongOrfsです。
プログラム：
NAME
Transdecoder.LongOrfs-トランスクリプトームタンパク質予測
USAGE
必須：
-NS トランスクリプト.fasta
任意：
-NS 最小タンパク質長（デフォルト：100）
-NS 遺伝暗号（デフォルト：ユニバーサル; PerlDocを参照;オプション：Euplotes、Tetrahymena、Candida、Acetabularia）
-Sストランド固有（トップストランドのみを分析）
遺伝の コード
見るhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>。 これらは現在サポートされています：
ユニバーサル（デフォルト）
ユープロテス
テトラヒメナ
カンジダ属
アセタブラリア
ミトコンドリア-カノニカル
ミトコンドリア-脊椎動物
ミトコンドリア-節足動物
ミトコンドリア-棘皮動物
ミトコンドリア-軟体動物
ミトコンドリア-ホヤ
ミトコンドリア-線虫
ミトコンドリア-扁形動物
ミトコンドリア-酵母
ミトコンドリア-Euascomycetes
ミトコンドリア-原生動物
2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)
onworks.netサービスを使用してTransDecoder.LongOrfsをオンラインで使用する
