これは、オンライン Linux で実行する CBMPy という名前の Linux アプリで、最新リリースは cbmpy-0.7.25.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
CBMPy という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する CBMPy
DESCRIPTION
PySCeS CBMPy は、制約ベースのモデリングと分析のための新しいプラットフォームです。 これは、PySCeS シミュレーション ソフトウェア プロジェクトで開発された、使いやすさ、柔軟性、アクセシビリティという原則を使用して設計されています。CBMPy は、CBM モデルのエンコード、SBML L3 FBC、COBRA のほか、MIRIAM 準拠の RDF およびカスタム アノテーションの最新のエンコード標準をサポートしています。
そのアーキテクチャは、生物学者にとって直感的なデータ構造を使用し、これらを基礎となる数学的構造に透過的に変換することで、拡張性と柔軟性の両方を備えています。
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CBMPy は、FBA、FVA、元素/電荷バランシング、ネットワーク分析、モデル編集などの一般的な分析と、エコシステム モデリング用に開発された高度な手法を実装します。
CBMPy は、以下を介したユーザー インタラクションをサポートします。
- インタラクティブなコンソールまたは高度な使用のためのライブラリとして
- GUI、モデルの視覚的表現、分析方法
- SOAP ベースの WebAPI は、Web サービス経由で高レベルの機能を公開します
オプション
- モデリング標準のサポート: SBML、SED-ML、SBML3FBC、OMEX (アーカイブの結合)
- MIRIAM 準拠のアノテーションを RDF としてサポートするだけでなく、カスタムのキーと値のデータもサポートします
- 複数のユーザー インターフェイス、GUI CLI、NOUI
- 柔軟でオープンなアーキテクチャ
Audience
科学/研究、教育、上級エンドユーザー、エンドユーザー/デスクトップ
ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル、wxWidgets
プログラミング言語
Python
これは、https://sourceforge.net/projects/cbmpy/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。