これは Chemical Trajectory Analyzer という名前の Linux アプリで、最新リリースは ChemTraYzer_2.1.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Chemical Trajectory Analyzer with OnWorks という名前のこのアプリをオンラインで無料でダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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化学飛跡分析装置
DESCRIPTION
ChemTraYzer は、分子動力学シミュレーションから反応モデルを作成します。 オープンソフトウェア（MITライセンス）として提供されています。 完全な説明を見つけてください @ https://www.ltt.rwth-aachen.de/cms/LTT/Forschung/Forschung-am-LTT/Model-Based-Fuel-Design/Aktuelle-Projekte/~kqbf/ChemTraYzer/lidx/1
M.Döntgen、M.-D.Przybylski-Freund、LCKröger、WAKopp、AEIsmail、K.Leonhard、「反応性分子動力学シミュレーションを使用した反応経路、速度定数、および遷移状態の自動発見」、J. Chem. 理論計算。 11 (2015)、2517-2524
LCKröger、WAKopp、M.Döntgen、K.Leonhard、「反応性分子動力学シミュレーションにおけるまれなイベントの統計的不確実性の評価」、J. Chem. 理論計算。 13 (2017)、3955-3960
M.Döntgen、F.Schmalz、WAKopp、LCKröger、K.Leonhard、「ハイブリッド反応性分子動力学および量子化学シミュレーションによる自動化学反応モデリング」、J. Chem. 情報モデル。 58 (2018)、1343-1355
バグレポートと修正については Wiki を確認してください。
オプション
- LAMMPS/ReaxFF軌道シミュレーションの処理
- 反応イベントの自動検出
- 速度定数の評価
- 後の視覚化のための反応ネットワークの生成
Audience
科学/研究、工学
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは、https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
