これは、Linux でオンラインで実行する FASTQSim という名前の Linux アプリで、最新リリースは FASTQsim_v2.0.tgz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
FASTQSim という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行する FASTQSim
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DESCRIPTION
FASTQSim は、次世代シーケンシング データセットの特性評価とメタゲノム データ生成の XNUMX つの機能を提供するツールです。FASTQSim はシーケンシング プラットフォームに依存せず、あらゆるシーケンシングのリード長、品質スコア、インデル率、単一点変異率、インデル サイズ、および同様の統計の分布を計算します。
プラットホーム。 トレーニングまたはテスト データセットを作成するために、FASTQSim には、ターゲット シーケンスを一致するイン シリコ リードに変換する機能があります。
エラープロファイル。
FASTQsim を使用すると、ユーザーは、シーケンス プロジェクトの計画やメタゲノム ソフトウェアのベンチマーク用の標準化されたテスト シナリオとして使用できる個々の読み取りデータセットをシミュレートできます。 この点において、FASTQsim ツールで生成されたインシリコ データセットには、自然データセットに比べていくつかの利点があります。シーケンス プラットフォームに依存せず、特性が非常に優れており、生成コストが安価です。
これは、https://sourceforge.net/projects/fastqsim/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
